مقامات قزاقستان نسبت به ساخت کانال قوش تپه در افغانستان ابراز نگرانی کرده‌اند و آن را تهدیدی جدی برای امنیت آبی کشورشان عنوان کرده است.
اصلان عبدالرحیم‌اوف، معاون منابع آبی قزاقستان، در نشستی در استانه هشدار داده که اجرای این پروژه می‌تواند منجر به کاهش چشمگیر جریان آب در رودخانه سیردریا شود.
به گزارش روزنامه “تایمز آف سنترل آسیا”، رهبر حزب “بایتاق قزاقستان” نیز هشدار داده است که کانال قوش تپه ممکن است بین ۲۵ تا ۳۰ درصد از آب رودخانه آمو را منحرف کند.
به گفته مقام‌های قزاق، این اقدام موجب کاهش میزان آب ورودی به ازبیکستان و ترکمنستان خواهد شد و در نهایت سطح آب رودخانه سیردریا در قزاقستان تا ۴۰ درصد کاهش می‌یابد.
پروژه کانال قوش تپه یکی از موضوعات اصلی در یک کنفرانس بین‌المللی در استانه بود، جایی که نمایندگان کشورهای تاجیکستان، قرغیزستان، افغانستان و ترکمنستان درباره تقسیم منابع آبی و پیامدهای احتمالی این پروژه بر آب منطقه به گفتگو پرداختند.